Desde los años ochenta, CEPLAES trabaja en este campo, realizando estudios sobre los impactos socioambientales derivados de políticas como la colonización, las actividades extractivistas, plantaciones, entre otras; sobre la incorporación de recursos naturales e impactos ambientales en las cuentas nacionales; la pequeña minería, incluido un estudio sobre las percepciones de la población de Intag al respecto, los impactos de la degradación ambiental en la salud de mujeres y niños de áreas urbano-populares.
En los noventa, impulsó un proceso de reflexión pionero en el país, en torno a la articulación entre mujeres y ambiente, que culminó con la realización del Encuentro internacional “Mujer y medio ambiente en América Latina y el Caribe” (1991); y del Seminario “La dimensión de género en las políticas y acciones ambientales ecuatorianas” (1995), cuyos resultados fueron ampliamente difundidos.
Desde 2010, el Centro lleva a cabo el programa “Derechos, Bosques y Cambio Climático”, orientado a construir y fortalecer las capacidades de los Pueblos y Nacionalidades en torno a temas como biodiversidad, manejo territorial y de los recursos del bosque, derechos y cambio climático. Este trabajo lo realizamos principalmente en la Amazonía centro sur y en la frontera sur del Ecuador con las nacionalidades Shuar, Achuar y Kichwa; y, con la población afrodescendiente de Esmeraldas.
Las líneas generales de trabajo están relacionadas a los impactos del cambio del clima, las iniciativas nacionales a internacionales de incentivos por conservación, incidencia en la aplicación de normas ambientales y forestales, fortalecimiento de la comunicación comunitaria, creación de una plataforma de jóvenes activistas. Además, se han producido materiales educativos con la participación de los Pueblos y Nacionalidades.